機關(guān)科室：
1 辦公室 ：
檢查是職能分工 ： 負責行業(yè)黨風廉政建設(shè)、紀檢信訪舉報、黨委日常辦公和黨建黨務(wù)、班子調(diào)整、干部選撥任用監(jiān)督與行風建設(shè)等工作。對口時監(jiān)察局、廳監(jiān)察室、聯(lián)系市直機關(guān)工委。
局辦公室職能分工：負責全局政務(wù)、人事、財務(wù)、勞資、職改、安全保衛(wèi)等工作；負責年度目標責任考核、政務(wù)信息的審核把關(guān)和對外發(fā)布；具體負責文秘、公文管理、辦公自動化、機要、保密、檔案、局機關(guān)財務(wù)、精神文明建設(shè)、資產(chǎn)管理、老干部、信訪、后勤接待、車輛管理及事務(wù)性管理工作；負責統(tǒng)一協(xié)調(diào)辦理全局督辦、人大議案、政協(xié)提案的辦理工作。負責政務(wù)工開、電子政務(wù)、信息宣傳、文明單位創(chuàng)建、黨組日常辦公。對口市委辦、市政府辦、市文明辦、廳辦公室、人教處、宣傳處、公安處、信息宣傳中心。
2 防汛抗旱：負責組織、協(xié)調(diào)、監(jiān)督、指導(dǎo)全市河道、受苦管理及沙石管理費征收上解工作；貶值病險水庫治理規(guī)劃，負責除險加固項目建議書、可行性研究報告及初步設(shè)計方案的初審及建設(shè)管理和指導(dǎo)，負責工程建設(shè)管理工作；貫徹實施國家關(guān)于防汛、抗旱等方面的法律法規(guī)；擬定全市防汛抗旱工作的長遠規(guī)劃和實施計劃；組織、協(xié)調(diào)、監(jiān)督、指導(dǎo)全市防汛抗旱減災(zāi)工作；組織編制商州城區(qū)度汛預(yù)案、審查縣區(qū)城市度汛預(yù)案、審批水庫、江河、集鎮(zhèn)度汛預(yù)案；審查堤防工程、水毀工程建設(shè)計劃、項目建議書及可行性研究報告，并負責建設(shè)管理和指導(dǎo)；編制防汛通訊網(wǎng)絡(luò)規(guī)劃，負責組織實施和管理工作；參與審查全市河道、堤防工程的規(guī)劃、水庫治理、除險加固工程計劃、項目建議書、可行性研究報告、初步設(shè)計；指導(dǎo)縣區(qū)防汛抗旱辦公室工作，負責汛期值班，做好全市水情、汛情、雨情、旱情等信息的收集、分析、傳遞和管理；爭取和管理防汛抗旱資金；負責水務(wù)信息等網(wǎng)絡(luò)管理工作。對口省防總辦、河庫處、信息中心、水文局。
3 河庫處職能分工:負責商洛市規(guī)劃城區(qū)段河流及各支溝河道入?yún)R口段500米內(nèi)的開發(fā)、利用、保護工作；負責組織、協(xié)調(diào)、管理市區(qū)河道、二龍山水庫管理區(qū)內(nèi)的砂石開采管理工作；及時調(diào)解和處理河道、水庫管轄范圍內(nèi)水事糾紛和組織實施河道、水庫、堤防的綠化美化工作；負責全市水庫移民工作；重點負責丹江河道城區(qū)段橡膠壩及水面、樹木、護欄、路燈等設(shè)施和二龍山水庫的管理、二龍二級電站、二龍東渠灌溉總站、丹江河道管理站四個單位的管理工作。對口廳河庫處、移民辦。
4 水管科職能分工:統(tǒng)籌負責水務(wù)系統(tǒng)各項改革工作，研究提出改革的意見和建議；負責基層水務(wù)服務(wù)體系建設(shè)和灌溉工程建后管理；聯(lián)系農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)中的水務(wù)工作。對口廳體改辦、農(nóng)水處。
5 水資辦（節(jié)約用水管理辦公室）職能分工:負責全市水資源管理、配置、節(jié)約和保護工作。組織指導(dǎo)水資源調(diào)查、評價和監(jiān)測工作，組織編制水資源專業(yè)規(guī)劃并監(jiān)督實施；組織實施全市水資源論證審查工作，依法征收管理水資源費；指導(dǎo)水資源信息發(fā)布，組織編制我市水資源公報和水質(zhì)旬報。負責全市水資源優(yōu)化配置工作，組織指導(dǎo)全市計劃用水、節(jié)約用水、城鄉(xiāng)供水的水源規(guī)劃及縣城自來水公司日常業(yè)務(wù)管理工作。組織編制水資源保護規(guī)劃，組織審定江河湖庫納污能力，提出限制排污總量的意見；負責全市及省界水質(zhì)監(jiān)督、監(jiān)測和入河排污口設(shè)置管理工作。組織指導(dǎo)全市地下水資源開發(fā)利用和保護工作。對口廳水資源與科技管理處、省地下水管理監(jiān)測局。
6 農(nóng)村水利
水電辦職能分工：負責全市水能資源的規(guī)劃、開發(fā)與水電建設(shè)管理工作；負責小水電以電代燃料工作。在計劃科的協(xié)調(diào)下開展工作。對口廳水電處。
飲水辦職能分工：負責全市農(nóng)村飲水工程項目規(guī)劃、年度計劃編制、項目審查、審批等前期管理及建設(shè)管理工作,承擔農(nóng)村供水各類信息報送，負責縣城供水工程建設(shè)。對口廳供水處。