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          搜索算法可助科學家發(fā)現(xiàn)腫瘤標志物

          搜索算法可助科學家發(fā)現(xiàn)腫瘤標志物

          2012-05-29 16:58:10

            搜索引擎不但能夠用來查找網(wǎng)頁,還能被用來確定腫瘤標志物。據(jù)物理學家組織網(wǎng)近日報道,德國德累斯頓工業(yè)大學的研究人員日前使用改良過的搜索引擎算法發(fā)現(xiàn)了7個腫瘤標志物,這些標志物不但可以幫助醫(yī)生對患者的病情作出準確診斷,還能幫助研究人員據(jù)此開發(fā)出新的抗癌藥物,在臨床上具有重要價值。相關(guān)論文發(fā)表在最新一期的《美國公共科學圖書館·計算生物學》上。

            此前要找到這些標志物需要經(jīng)過大量的實驗,不但費時而且費力。另外一個問題是,在不同的研究中所發(fā)現(xiàn)的標志物總是各不相同,無法相互印證。德累斯頓工業(yè)大學的科學家發(fā)現(xiàn)這與搜索引擎在處理大量重復網(wǎng)頁和超鏈接時所遇到問題頗有幾分類似。于是他們對谷歌網(wǎng)頁排名(PageRank)算法進行了改造,按與胰腺癌的相關(guān)性對2萬個蛋白質(zhì)進行了排序,結(jié)果從中發(fā)現(xiàn)了7個腫瘤標志物。這些生物標志物可以幫助醫(yī)生對癌癥早期的體液或由手術(shù)中所獲得的活體組織進行檢查,以確定患者是否需要接受化療。

            研究人員發(fā)現(xiàn),一旦將網(wǎng)絡(luò)信息加入到分析當中,這些標志物就會變得更易重復。其中一項就與美國北卡羅來納大學早期的一項重要發(fā)現(xiàn)相重疊,該標志物能對胰腺癌的侵略性進行評估。

            論文第一作者克里斯托夫·文特說,雖然新的生物標志物看起來比目前所使用的更多更全面,但它們還需要經(jīng)過進一步的研究和臨床試驗才能獲得應用。“但不管怎么說,我們成功邁出了第一步。”文特說。目前該研究小組已經(jīng)與幾家生物技術(shù)公司展開了合作,胰腺癌藥物的臨床試驗也已逐步展開。(新華網(wǎng))

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